Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRBOX4Q5JUW0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRBOX4Q5JUW0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRBOX4Q5JUW0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRBOX4Q5JUW0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRBOX4Q5JUW0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRBOX4Q5JUW0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRBOX4Q5JUW0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRBOX4Q5JUW0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRBOX4Q5JUW0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRBOX4Q5JUW0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRBOX4Q5JUW0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBOX4Q5JUW0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBOX4Q5JUW0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRBOX4Q5JUW0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRBOX4Q5JUW0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRBOX4Q5JUW0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms