Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SFT2D3Q587I9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFT2D3Q587I9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SFT2D3Q587I9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFT2D3Q587I9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFT2D3Q587I9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFT2D3Q587I9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFT2D3Q587I9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFT2D3Q587I9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFT2D3Q587I9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms