Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC01620Q4KN68 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01620Q4KN68 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01620Q4KN68 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01620Q4KN68 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01620Q4KN68 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms