Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LONRF3Q496Y0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LONRF3Q496Y0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LONRF3Q496Y0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LONRF3Q496Y0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LONRF3Q496Y0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LONRF3Q496Y0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LONRF3Q496Y0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LONRF3Q496Y0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LONRF3Q496Y0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LONRF3Q496Y0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LONRF3Q496Y0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LONRF3Q496Y0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LONRF3Q496Y0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LONRF3Q496Y0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LONRF3Q496Y0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LONRF3Q496Y0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LONRF3Q496Y0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
LONRF3Q496Y0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LONRF3Q496Y0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LONRF3Q496Y0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LONRF3Q496Y0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LONRF3Q496Y0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms