Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCV2

LEXM, Lymphocyte expansion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEXMQ3ZCV2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LEXMQ3ZCV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LEXMQ3ZCV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LEXMQ3ZCV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LEXMQ3ZCV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LEXMQ3ZCV2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LEXMQ3ZCV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LEXMQ3ZCV2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LEXMQ3ZCV2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LEXMQ3ZCV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEXMQ3ZCV2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LEXMQ3ZCV2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LEXMQ3ZCV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LEXMQ3ZCV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LEXMQ3ZCV2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LEXMQ3ZCV2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LEXMQ3ZCV2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LEXMQ3ZCV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LEXMQ3ZCV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LEXMQ3ZCV2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LEXMQ3ZCV2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LEXMQ3ZCV2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LEXMQ3ZCV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LEXMQ3ZCV2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LEXMQ3ZCV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LEXMQ3ZCV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LEXMQ3ZCV2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LEXMQ3ZCV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms