Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF3Q3KNV8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCGF3Q3KNV8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCGF3Q3KNV8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF3Q3KNV8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF3Q3KNV8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF3Q3KNV8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF3Q3KNV8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms