Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ISXQ2M1V0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ISXQ2M1V0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ISXQ2M1V0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ISXQ2M1V0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ISXQ2M1V0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ISXQ2M1V0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ISXQ2M1V0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ISXQ2M1V0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ISXQ2M1V0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms