Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK2Q16620 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK2Q16620 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK2Q16620 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTRK2Q16620 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NTRK2Q16620 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK2Q16620 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK2Q16620 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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