Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACKR1Q16570 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACKR1Q16570 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACKR1Q16570 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACKR1Q16570 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACKR1Q16570 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACKR1Q16570 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACKR1Q16570 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR1Q16570 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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