Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LAMA4Q16363 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LAMA4Q16363 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LAMA4Q16363 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LAMA4Q16363 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LAMA4Q16363 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LAMA4Q16363 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LAMA4Q16363 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LAMA4Q16363 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMA4Q16363 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMA4Q16363 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LAMA4Q16363 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LAMA4Q16363 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LAMA4Q16363 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LAMA4Q16363 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LAMA4Q16363 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
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