Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNGA3Q16281 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNGA3Q16281 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGA3Q16281 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGA3Q16281 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNGA3Q16281 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNGA3Q16281 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNGA3Q16281 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNGA3Q16281 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNGA3Q16281 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNGA3Q16281 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA3Q16281 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA3Q16281 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA3Q16281 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CNGA3Q16281 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNGA3Q16281 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGA3Q16281 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNGA3Q16281 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA3Q16281 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGA3Q16281 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA3Q16281 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA3Q16281 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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