Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
E2F4Q16254 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
E2F4Q16254 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
E2F4Q16254 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
E2F4Q16254 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
E2F4Q16254 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
E2F4Q16254 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E2F4Q16254 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
E2F4Q16254 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
E2F4Q16254 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
E2F4Q16254 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
E2F4Q16254 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
E2F4Q16254 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
E2F4Q16254 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
E2F4Q16254 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
E2F4Q16254 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
E2F4Q16254 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
E2F4Q16254 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
E2F4Q16254 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
E2F4Q16254 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
E2F4Q16254 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
E2F4Q16254 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
E2F4Q16254 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
E2F4Q16254 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
E2F4Q16254 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
E2F4Q16254 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
E2F4Q16254 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
E2F4Q16254 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
E2F4Q16254 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
E2F4Q16254 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
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