Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
NCOA1Q15788 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NCOA1Q15788 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NCOA1Q15788 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NCOA1Q15788 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
NCOA1Q15788 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NCOA1Q15788 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NCOA1Q15788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NCOA1Q15788 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
NCOA1Q15788 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NCOA1Q15788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NCOA1Q15788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
NCOA1Q15788 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
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