Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMAD4Q13485 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMAD4Q13485 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMAD4Q13485 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMAD4Q13485 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMAD4Q13485 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD4Q13485 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD4Q13485 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD4Q13485 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMAD4Q13485 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMAD4Q13485 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMAD4Q13485 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SMAD4Q13485 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMAD4Q13485 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMAD4Q13485 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMAD4Q13485 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMAD4Q13485 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMAD4Q13485 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMAD4Q13485 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
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