Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRSF5Q13243 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRSF5Q13243 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRSF5Q13243 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRSF5Q13243 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SRSF5Q13243 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SRSF5Q13243 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRSF5Q13243 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRSF5Q13243 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRSF5Q13243 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRSF5Q13243 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRSF5Q13243 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRSF5Q13243 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRSF5Q13243 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRSF5Q13243 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRSF5Q13243 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRSF5Q13243 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SRSF5Q13243 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRSF5Q13243 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRSF5Q13243 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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