Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SREBF2Q12772 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SREBF2Q12772 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SREBF2Q12772 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SREBF2Q12772 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SREBF2Q12772 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SREBF2Q12772 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SREBF2Q12772 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SREBF2Q12772 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SREBF2Q12772 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SREBF2Q12772 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SREBF2Q12772 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SREBF2Q12772 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SREBF2Q12772 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SREBF2Q12772 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SREBF2Q12772 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SREBF2Q12772 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SREBF2Q12772 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SREBF2Q12772 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SREBF2Q12772 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SREBF2Q12772 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SREBF2Q12772 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SREBF2Q12772 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SREBF2Q12772 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SREBF2Q12772 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SREBF2Q12772 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SREBF2Q12772 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SREBF2Q12772 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SREBF2Q12772 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SREBF2Q12772 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
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