Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NIPAL4Q0D2K0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NIPAL4Q0D2K0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NIPAL4Q0D2K0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NIPAL4Q0D2K0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NIPAL4Q0D2K0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NIPAL4Q0D2K0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NIPAL4Q0D2K0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NIPAL4Q0D2K0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NIPAL4Q0D2K0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NIPAL4Q0D2K0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NIPAL4Q0D2K0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NIPAL4Q0D2K0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NIPAL4Q0D2K0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NIPAL4Q0D2K0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIPAL4Q0D2K0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIPAL4Q0D2K0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NIPAL4Q0D2K0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NIPAL4Q0D2K0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NIPAL4Q0D2K0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms