Protein–RNA interactions for Protein: Q09MP3

RAD51AP2, RAD51-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51AP2Q09MP3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAD51AP2Q09MP3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAD51AP2Q09MP3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAD51AP2Q09MP3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD51AP2Q09MP3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RAD51AP2Q09MP3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RAD51AP2Q09MP3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAD51AP2Q09MP3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RAD51AP2Q09MP3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD51AP2Q09MP3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD51AP2Q09MP3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD51AP2Q09MP3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAD51AP2Q09MP3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RAD51AP2Q09MP3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RAD51AP2Q09MP3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
RAD51AP2Q09MP3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAD51AP2Q09MP3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD51AP2Q09MP3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD51AP2Q09MP3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD51AP2Q09MP3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1537.5 ms