Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNP2Q05952 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNP2Q05952 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNP2Q05952 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNP2Q05952 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNP2Q05952 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNP2Q05952 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNP2Q05952 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNP2Q05952 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNP2Q05952 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNP2Q05952 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNP2Q05952 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms