Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMNB2Q03252 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMNB2Q03252 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMNB2Q03252 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMNB2Q03252 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMNB2Q03252 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMNB2Q03252 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMNB2Q03252 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNB2Q03252 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMNB2Q03252 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms