Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHDQ02161 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHDQ02161 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHDQ02161 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHDQ02161 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHDQ02161 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHDQ02161 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHDQ02161 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHDQ02161 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RHDQ02161 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHDQ02161 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RHDQ02161 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHDQ02161 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHDQ02161 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHDQ02161 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHDQ02161 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHDQ02161 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RHDQ02161 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHDQ02161 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHDQ02161 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHDQ02161 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHDQ02161 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHDQ02161 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHDQ02161 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHDQ02161 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHDQ02161 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHDQ02161 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHDQ02161 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHDQ02161 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHDQ02161 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHDQ02161 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHDQ02161 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHDQ02161 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHDQ02161 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHDQ02161 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHDQ02161 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHDQ02161 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHDQ02161 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHDQ02161 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHDQ02161 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHDQ02161 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RHDQ02161 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHDQ02161 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHDQ02161 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHDQ02161 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHDQ02161 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHDQ02161 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHDQ02161 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RHDQ02161 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHDQ02161 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHDQ02161 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHDQ02161 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHDQ02161 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHDQ02161 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHDQ02161 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHDQ02161 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHDQ02161 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHDQ02161 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHDQ02161 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHDQ02161 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHDQ02161 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHDQ02161 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHDQ02161 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RHDQ02161 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHDQ02161 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHDQ02161 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHDQ02161 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHDQ02161 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHDQ02161 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RHDQ02161 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHDQ02161 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHDQ02161 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHDQ02161 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHDQ02161 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHDQ02161 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHDQ02161 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHDQ02161 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHDQ02161 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHDQ02161 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RHDQ02161 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHDQ02161 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHDQ02161 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHDQ02161 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHDQ02161 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RHDQ02161 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHDQ02161 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHDQ02161 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RHDQ02161 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHDQ02161 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RHDQ02161 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHDQ02161 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHDQ02161 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHDQ02161 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHDQ02161 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHDQ02161 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHDQ02161 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHDQ02161 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHDQ02161 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHDQ02161 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHDQ02161 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms