Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CAP1Q01518 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CAP1Q01518 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CAP1Q01518 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CAP1Q01518 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CAP1Q01518 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CAP1Q01518 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CAP1Q01518 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CAP1Q01518 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CAP1Q01518 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CAP1Q01518 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CAP1Q01518 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CAP1Q01518 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CAP1Q01518 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CAP1Q01518 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CAP1Q01518 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CAP1Q01518 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CAP1Q01518 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CAP1Q01518 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms