Protein–RNA interactions for Protein: P99999

CYCS, Cytochrome c, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP99999 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYCSP99999 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYCSP99999 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYCSP99999 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYCSP99999 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYCSP99999 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYCSP99999 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYCSP99999 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYCSP99999 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYCSP99999 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYCSP99999 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYCSP99999 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYCSP99999 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYCSP99999 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYCSP99999 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYCSP99999 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYCSP99999 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYCSP99999 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYCSP99999 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYCSP99999 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYCSP99999 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYCSP99999 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYCSP99999 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYCSP99999 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYCSP99999 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYCSP99999 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYCSP99999 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYCSP99999 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYCSP99999 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYCSP99999 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYCSP99999 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYCSP99999 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYCSP99999 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYCSP99999 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYCSP99999 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYCSP99999 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYCSP99999 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYCSP99999 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYCSP99999 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYCSP99999 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYCSP99999 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYCSP99999 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYCSP99999 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYCSP99999 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYCSP99999 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYCSP99999 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYCSP99999 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYCSP99999 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYCSP99999 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYCSP99999 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYCSP99999 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYCSP99999 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYCSP99999 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYCSP99999 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYCSP99999 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYCSP99999 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYCSP99999 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYCSP99999 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYCSP99999 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYCSP99999 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYCSP99999 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYCSP99999 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYCSP99999 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYCSP99999 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYCSP99999 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYCSP99999 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYCSP99999 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYCSP99999 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYCSP99999 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYCSP99999 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYCSP99999 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYCSP99999 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYCSP99999 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYCSP99999 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYCSP99999 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYCSP99999 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYCSP99999 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYCSP99999 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYCSP99999 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYCSP99999 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYCSP99999 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYCSP99999 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYCSP99999 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYCSP99999 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYCSP99999 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYCSP99999 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYCSP99999 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYCSP99999 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYCSP99999 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYCSP99999 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYCSP99999 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYCSP99999 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYCSP99999 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYCSP99999 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYCSP99999 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYCSP99999 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYCSP99999 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYCSP99999 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYCSP99999 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYCSP99999 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms