Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSBP2P81877 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSBP2P81877 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSBP2P81877 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSBP2P81877 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSBP2P81877 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSBP2P81877 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSBP2P81877 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSBP2P81877 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSBP2P81877 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSBP2P81877 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSBP2P81877 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSBP2P81877 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP2P81877 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP2P81877 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP2P81877 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP2P81877 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP2P81877 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP2P81877 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP2P81877 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP2P81877 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP2P81877 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP2P81877 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP2P81877 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSBP2P81877 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP2P81877 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP2P81877 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSBP2P81877 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP2P81877 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP2P81877 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SSBP2P81877 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSBP2P81877 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSBP2P81877 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms