Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL20P78556 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL20P78556 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL20P78556 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL20P78556 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL20P78556 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL20P78556 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL20P78556 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL20P78556 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL20P78556 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL20P78556 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL20P78556 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL20P78556 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL20P78556 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL20P78556 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL20P78556 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL20P78556 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL20P78556 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL20P78556 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL20P78556 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL20P78556 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL20P78556 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL20P78556 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL20P78556 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL20P78556 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL20P78556 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL20P78556 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL20P78556 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL20P78556 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL20P78556 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL20P78556 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL20P78556 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL20P78556 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL20P78556 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL20P78556 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL20P78556 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL20P78556 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL20P78556 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCL20P78556 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCL20P78556 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCL20P78556 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL20P78556 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCL20P78556 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCL20P78556 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCL20P78556 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCL20P78556 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL20P78556 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL20P78556 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCL20P78556 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL20P78556 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL20P78556 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCL20P78556 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL20P78556 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL20P78556 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCL20P78556 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL20P78556 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL20P78556 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCL20P78556 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCL20P78556 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL20P78556 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms