Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPHP78330 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPHP78330 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSPHP78330 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSPHP78330 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPHP78330 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPHP78330 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSPHP78330 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPHP78330 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPHP78330 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPHP78330 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSPHP78330 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPHP78330 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPHP78330 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSPHP78330 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPHP78330 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSPHP78330 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPHP78330 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSPHP78330 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSPHP78330 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPHP78330 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSPHP78330 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSPHP78330 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPHP78330 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPHP78330 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSPHP78330 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSPHP78330 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPHP78330 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSPHP78330 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSPHP78330 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPHP78330 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPHP78330 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSPHP78330 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPHP78330 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSPHP78330 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPHP78330 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSPHP78330 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPHP78330 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPHP78330 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPHP78330 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSPHP78330 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPHP78330 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPHP78330 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPHP78330 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSPHP78330 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSPHP78330 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPHP78330 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPHP78330 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSPHP78330 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSPHP78330 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSPHP78330 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSPHP78330 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSPHP78330 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSPHP78330 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSPHP78330 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSPHP78330 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPHP78330 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPHP78330 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPHP78330 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPHP78330 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSPHP78330 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPHP78330 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSPHP78330 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPHP78330 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPHP78330 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPHP78330 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPHP78330 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSPHP78330 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPHP78330 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSPHP78330 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPHP78330 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPHP78330 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPHP78330 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPHP78330 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSPHP78330 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPHP78330 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPHP78330 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPHP78330 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPHP78330 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSPHP78330 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSPHP78330 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSPHP78330 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPHP78330 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPHP78330 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPHP78330 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPHP78330 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSPHP78330 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSPHP78330 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPHP78330 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPHP78330 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPHP78330 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPHP78330 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPHP78330 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPHP78330 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPHP78330 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSPHP78330 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPHP78330 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPHP78330 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPHP78330 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPHP78330 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms