Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARPC4P59998 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARPC4P59998 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC4P59998 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARPC4P59998 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARPC4P59998 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC4P59998 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARPC4P59998 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms