Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00313P59037 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00313P59037 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00313P59037 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00313P59037 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00313P59037 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00313P59037 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00313P59037 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00313P59037 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00313P59037 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00313P59037 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00313P59037 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00313P59037 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00313P59037 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00313P59037 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00313P59037 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms