Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIMK1P53667 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIMK1P53667 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIMK1P53667 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMK1P53667 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMK1P53667 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LIMK1P53667 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIMK1P53667 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIMK1P53667 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIMK1P53667 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIMK1P53667 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LIMK1P53667 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIMK1P53667 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIMK1P53667 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIMK1P53667 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIMK1P53667 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIMK1P53667 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIMK1P53667 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIMK1P53667 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LIMK1P53667 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIMK1P53667 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms