Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KPNA2P52292 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KPNA2P52292 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KPNA2P52292 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KPNA2P52292 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KPNA2P52292 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KPNA2P52292 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KPNA2P52292 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KPNA2P52292 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KPNA2P52292 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KPNA2P52292 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KPNA2P52292 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KPNA2P52292 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KPNA2P52292 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KPNA2P52292 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms