Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF144AP50876 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF144AP50876 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF144AP50876 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF144AP50876 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF144AP50876 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF144AP50876 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF144AP50876 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF144AP50876 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF144AP50876 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF144AP50876 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF144AP50876 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF144AP50876 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF144AP50876 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF144AP50876 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF144AP50876 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF144AP50876 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF144AP50876 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF144AP50876 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF144AP50876 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF144AP50876 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF144AP50876 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF144AP50876 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF144AP50876 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF144AP50876 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF144AP50876 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF144AP50876 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms