Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBP2P50120 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP2P50120 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBP2P50120 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP2P50120 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBP2P50120 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBP2P50120 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP2P50120 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP2P50120 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP2P50120 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP2P50120 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP2P50120 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP2P50120 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP2P50120 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP2P50120 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP2P50120 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP2P50120 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP2P50120 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP2P50120 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP2P50120 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP2P50120 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP2P50120 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP2P50120 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP2P50120 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP2P50120 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP2P50120 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP2P50120 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP2P50120 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP2P50120 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBP2P50120 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBP2P50120 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP2P50120 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBP2P50120 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP2P50120 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP2P50120 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP2P50120 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP2P50120 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP2P50120 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP2P50120 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP2P50120 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP2P50120 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP2P50120 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP2P50120 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP2P50120 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP2P50120 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP2P50120 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP2P50120 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP2P50120 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP2P50120 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP2P50120 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP2P50120 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP2P50120 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP2P50120 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP2P50120 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP2P50120 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP2P50120 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP2P50120 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBP2P50120 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP2P50120 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP2P50120 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBP2P50120 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP2P50120 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP2P50120 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP2P50120 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBP2P50120 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP2P50120 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP2P50120 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBP2P50120 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP2P50120 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP2P50120 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBP2P50120 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP2P50120 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP2P50120 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP2P50120 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP2P50120 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP2P50120 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP2P50120 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBP2P50120 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP2P50120 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP2P50120 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBP2P50120 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP2P50120 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP2P50120 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBP2P50120 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP2P50120 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBP2P50120 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP2P50120 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP2P50120 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBP2P50120 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP2P50120 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP2P50120 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP2P50120 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP2P50120 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBP2P50120 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP2P50120 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP2P50120 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP2P50120 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBP2P50120 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP2P50120 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBP2P50120 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms