Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC34P49427 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC34P49427 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC34P49427 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC34P49427 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC34P49427 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC34P49427 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC34P49427 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC34P49427 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC34P49427 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC34P49427 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC34P49427 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC34P49427 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC34P49427 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC34P49427 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC34P49427 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC34P49427 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC34P49427 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC34P49427 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC34P49427 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC34P49427 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC34P49427 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC34P49427 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC34P49427 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC34P49427 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC34P49427 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC34P49427 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC34P49427 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC34P49427 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC34P49427 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC34P49427 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC34P49427 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC34P49427 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC34P49427 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC34P49427 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDC34P49427 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC34P49427 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC34P49427 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC34P49427 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDC34P49427 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDC34P49427 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC34P49427 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDC34P49427 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC34P49427 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC34P49427 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDC34P49427 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDC34P49427 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC34P49427 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDC34P49427 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC34P49427 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC34P49427 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC34P49427 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDC34P49427 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC34P49427 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC34P49427 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDC34P49427 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC34P49427 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC34P49427 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC34P49427 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC34P49427 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC34P49427 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC34P49427 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC34P49427 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC34P49427 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC34P49427 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC34P49427 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC34P49427 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC34P49427 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC34P49427 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC34P49427 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC34P49427 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC34P49427 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC34P49427 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC34P49427 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC34P49427 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC34P49427 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC34P49427 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC34P49427 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC34P49427 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC34P49427 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDC34P49427 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC34P49427 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC34P49427 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDC34P49427 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC34P49427 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC34P49427 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC34P49427 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC34P49427 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC34P49427 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDC34P49427 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC34P49427 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC34P49427 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC34P49427 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC34P49427 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDC34P49427 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDC34P49427 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC34P49427 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC34P49427 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC34P49427 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDC34P49427 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms