Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD8P48556 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD8P48556 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD8P48556 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSMD8P48556 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD8P48556 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD8P48556 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD8P48556 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD8P48556 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD8P48556 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD8P48556 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMD8P48556 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMD8P48556 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMD8P48556 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PSMD8P48556 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSMD8P48556 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSMD8P48556 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMD8P48556 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PSMD8P48556 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMD8P48556 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMD8P48556 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms