Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCAP37840 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNCAP37840 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNCAP37840 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNCAP37840 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCAP37840 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNCAP37840 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCAP37840 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNCAP37840 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCAP37840 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCAP37840 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCAP37840 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCAP37840 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCAP37840 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCAP37840 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCAP37840 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCAP37840 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCAP37840 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCAP37840 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCAP37840 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCAP37840 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCAP37840 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNCAP37840 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCAP37840 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNCAP37840 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNCAP37840 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCAP37840 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCAP37840 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCAP37840 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCAP37840 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCAP37840 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCAP37840 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCAP37840 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCAP37840 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCAP37840 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCAP37840 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCAP37840 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCAP37840 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCAP37840 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCAP37840 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCAP37840 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCAP37840 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCAP37840 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCAP37840 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCAP37840 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCAP37840 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCAP37840 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNCAP37840 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCAP37840 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCAP37840 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCAP37840 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCAP37840 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCAP37840 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCAP37840 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCAP37840 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCAP37840 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCAP37840 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCAP37840 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCAP37840 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCAP37840 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCAP37840 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCAP37840 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCAP37840 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCAP37840 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCAP37840 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNCAP37840 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCAP37840 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCAP37840 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCAP37840 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCAP37840 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCAP37840 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCAP37840 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCAP37840 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCAP37840 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCAP37840 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCAP37840 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCAP37840 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCAP37840 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCAP37840 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCAP37840 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCAP37840 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNCAP37840 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCAP37840 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNCAP37840 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCAP37840 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCAP37840 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNCAP37840 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNCAP37840 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNCAP37840 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCAP37840 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNCAP37840 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms