Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC1P35251 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC1P35251 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFC1P35251 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFC1P35251 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFC1P35251 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFC1P35251 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFC1P35251 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFC1P35251 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFC1P35251 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFC1P35251 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RFC1P35251 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RFC1P35251 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFC1P35251 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFC1P35251 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RFC1P35251 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFC1P35251 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RFC1P35251 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFC1P35251 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RFC1P35251 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RFC1P35251 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RFC1P35251 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RFC1P35251 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFC1P35251 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFC1P35251 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RFC1P35251 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RFC1P35251 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFC1P35251 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFC1P35251 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RFC1P35251 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFC1P35251 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFC1P35251 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFC1P35251 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RFC1P35251 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFC1P35251 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFC1P35251 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RFC1P35251 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RFC1P35251 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFC1P35251 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFC1P35251 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFC1P35251 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFC1P35251 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RFC1P35251 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFC1P35251 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFC1P35251 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFC1P35251 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFC1P35251 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RFC1P35251 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RFC1P35251 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFC1P35251 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFC1P35251 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFC1P35251 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC1P35251 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC1P35251 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFC1P35251 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RFC1P35251 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFC1P35251 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFC1P35251 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFC1P35251 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFC1P35251 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFC1P35251 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RFC1P35251 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RFC1P35251 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RFC1P35251 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFC1P35251 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFC1P35251 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RFC1P35251 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFC1P35251 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFC1P35251 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFC1P35251 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFC1P35251 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFC1P35251 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFC1P35251 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC1P35251 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC1P35251 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC1P35251 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFC1P35251 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFC1P35251 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC1P35251 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC1P35251 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RFC1P35251 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFC1P35251 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RFC1P35251 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFC1P35251 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFC1P35251 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFC1P35251 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFC1P35251 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFC1P35251 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC1P35251 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RFC1P35251 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC1P35251 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC1P35251 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC1P35251 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC1P35251 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC1P35251 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFC1P35251 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC1P35251 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC1P35251 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFC1P35251 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFC1P35251 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms