Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRNP28799 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRNP28799 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRNP28799 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRNP28799 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRNP28799 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRNP28799 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRNP28799 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRNP28799 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRNP28799 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRNP28799 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRNP28799 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRNP28799 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRNP28799 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRNP28799 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRNP28799 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRNP28799 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRNP28799 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRNP28799 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRNP28799 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRNP28799 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRNP28799 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRNP28799 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRNP28799 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRNP28799 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRNP28799 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRNP28799 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRNP28799 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRNP28799 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRNP28799 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRNP28799 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRNP28799 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRNP28799 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRNP28799 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRNP28799 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRNP28799 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRNP28799 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRNP28799 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRNP28799 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRNP28799 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRNP28799 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRNP28799 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRNP28799 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRNP28799 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRNP28799 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRNP28799 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRNP28799 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRNP28799 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRNP28799 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRNP28799 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRNP28799 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRNP28799 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRNP28799 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRNP28799 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRNP28799 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRNP28799 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRNP28799 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRNP28799 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRNP28799 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRNP28799 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRNP28799 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRNP28799 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRNP28799 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRNP28799 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRNP28799 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRNP28799 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRNP28799 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRNP28799 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRNP28799 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRNP28799 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRNP28799 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRNP28799 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRNP28799 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRNP28799 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRNP28799 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRNP28799 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRNP28799 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRNP28799 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRNP28799 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRNP28799 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRNP28799 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRNP28799 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRNP28799 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRNP28799 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRNP28799 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRNP28799 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRNP28799 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRNP28799 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRNP28799 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRNP28799 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRNP28799 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRNP28799 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRNP28799 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRNP28799 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRNP28799 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRNP28799 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRNP28799 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRNP28799 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRNP28799 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRNP28799 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms