Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFYAP23511 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFYAP23511 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFYAP23511 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFYAP23511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFYAP23511 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFYAP23511 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFYAP23511 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFYAP23511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFYAP23511 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFYAP23511 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFYAP23511 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFYAP23511 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFYAP23511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFYAP23511 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFYAP23511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFYAP23511 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFYAP23511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFYAP23511 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFYAP23511 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFYAP23511 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFYAP23511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFYAP23511 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFYAP23511 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFYAP23511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFYAP23511 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFYAP23511 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFYAP23511 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFYAP23511 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFYAP23511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFYAP23511 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFYAP23511 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFYAP23511 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFYAP23511 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFYAP23511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFYAP23511 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFYAP23511 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFYAP23511 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFYAP23511 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFYAP23511 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFYAP23511 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFYAP23511 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFYAP23511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFYAP23511 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFYAP23511 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFYAP23511 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFYAP23511 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFYAP23511 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFYAP23511 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFYAP23511 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFYAP23511 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFYAP23511 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFYAP23511 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFYAP23511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFYAP23511 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFYAP23511 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFYAP23511 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFYAP23511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFYAP23511 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFYAP23511 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFYAP23511 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFYAP23511 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFYAP23511 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFYAP23511 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFYAP23511 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFYAP23511 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFYAP23511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFYAP23511 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFYAP23511 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFYAP23511 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFYAP23511 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFYAP23511 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFYAP23511 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFYAP23511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFYAP23511 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFYAP23511 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFYAP23511 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFYAP23511 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFYAP23511 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFYAP23511 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFYAP23511 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFYAP23511 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFYAP23511 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFYAP23511 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFYAP23511 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFYAP23511 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFYAP23511 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFYAP23511 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFYAP23511 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFYAP23511 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFYAP23511 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFYAP23511 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFYAP23511 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFYAP23511 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFYAP23511 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFYAP23511 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFYAP23511 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFYAP23511 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFYAP23511 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFYAP23511 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms