Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR4A1P22736 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR4A1P22736 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A1P22736 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NR4A1P22736 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A1P22736 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A1P22736 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A1P22736 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms