Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB4AP20338 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB4AP20338 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB4AP20338 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB4AP20338 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB4AP20338 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB4AP20338 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB4AP20338 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB4AP20338 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms