Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD33P20138 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD33P20138 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD33P20138 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD33P20138 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD33P20138 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD33P20138 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD33P20138 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD33P20138 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD33P20138 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD33P20138 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD33P20138 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD33P20138 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD33P20138 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD33P20138 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD33P20138 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD33P20138 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD33P20138 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD33P20138 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD33P20138 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD33P20138 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD33P20138 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD33P20138 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD33P20138 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD33P20138 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD33P20138 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD33P20138 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CD33P20138 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD33P20138 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD33P20138 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD33P20138 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD33P20138 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD33P20138 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD33P20138 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD33P20138 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD33P20138 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD33P20138 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD33P20138 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD33P20138 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD33P20138 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD33P20138 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD33P20138 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD33P20138 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD33P20138 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD33P20138 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD33P20138 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD33P20138 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD33P20138 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD33P20138 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD33P20138 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD33P20138 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD33P20138 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD33P20138 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD33P20138 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD33P20138 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD33P20138 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD33P20138 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD33P20138 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD33P20138 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD33P20138 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD33P20138 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD33P20138 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD33P20138 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD33P20138 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD33P20138 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD33P20138 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD33P20138 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD33P20138 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD33P20138 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD33P20138 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD33P20138 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD33P20138 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD33P20138 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD33P20138 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD33P20138 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD33P20138 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD33P20138 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CD33P20138 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CD33P20138 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD33P20138 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD33P20138 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD33P20138 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD33P20138 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD33P20138 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD33P20138 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD33P20138 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CD33P20138 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD33P20138 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD33P20138 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD33P20138 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms