Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF28P17035 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF28P17035 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF28P17035 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF28P17035 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF28P17035 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF28P17035 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF28P17035 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF28P17035 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF28P17035 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF28P17035 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF28P17035 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF28P17035 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF28P17035 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF28P17035 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF28P17035 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF28P17035 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms