Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
VEGFAP15692 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
VEGFAP15692 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
VEGFAP15692 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
VEGFAP15692 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
VEGFAP15692 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VEGFAP15692 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
VEGFAP15692 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VEGFAP15692 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VEGFAP15692 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
VEGFAP15692 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
VEGFAP15692 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VEGFAP15692 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VEGFAP15692 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VEGFAP15692 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VEGFAP15692 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VEGFAP15692 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VEGFAP15692 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VEGFAP15692 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VEGFAP15692 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VEGFAP15692 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VEGFAP15692 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VEGFAP15692 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VEGFAP15692 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VEGFAP15692 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VEGFAP15692 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VEGFAP15692 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VEGFAP15692 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VEGFAP15692 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
VEGFAP15692 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VEGFAP15692 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VEGFAP15692 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VEGFAP15692 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VEGFAP15692 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VEGFAP15692 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VEGFAP15692 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
VEGFAP15692 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VEGFAP15692 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VEGFAP15692 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms