Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF44P15621 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF44P15621 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF44P15621 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF44P15621 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF44P15621 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF44P15621 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF44P15621 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF44P15621 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF44P15621 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF44P15621 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF44P15621 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF44P15621 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF44P15621 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF44P15621 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF44P15621 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF44P15621 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF44P15621 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF44P15621 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF44P15621 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms