Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPBP14678 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPBP14678 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPBP14678 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPBP14678 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPBP14678 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPBP14678 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPBP14678 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPBP14678 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPBP14678 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.9 ms