Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM1P13164 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM1P13164 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFITM1P13164 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IFITM1P13164 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM1P13164 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFITM1P13164 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms