Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CYP2C9P11712 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CYP2C9P11712 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CYP2C9P11712 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CYP2C9P11712 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CYP2C9P11712 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CYP2C9P11712 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CYP2C9P11712 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CYP2C9P11712 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CYP2C9P11712 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CYP2C9P11712 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYP2C9P11712 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYP2C9P11712 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CYP2C9P11712 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms