Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAMP11215 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAMP11215 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAMP11215 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAMP11215 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAMP11215 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAMP11215 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAMP11215 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAMP11215 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAMP11215 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAMP11215 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAMP11215 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAMP11215 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAMP11215 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms