Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR2F1P10589 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR2F1P10589 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR2F1P10589 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR2F1P10589 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR2F1P10589 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NR2F1P10589 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2F1P10589 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2F1P10589 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2F1P10589 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms