Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSIG10L2P0DP72 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VSIG10L2P0DP72 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSIG10L2P0DP72 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSIG10L2P0DP72 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG10L2P0DP72 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG10L2P0DP72 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VSIG10L2P0DP72 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms